НДФЛ можно удерживать из любых доходов

Если компания выплачивает физическому лицу несколько видов доходов, то налоговый агент может удержать налог за счет любых средств.

При невозможности удержать у налогоплательщика исчисленную сумму налога, отмечает Минфин, налоговый агент в течение одного месяца с момента возникновения этого обстоятельства в письменной форме уведомляет налоговый орган по месту своего учета о невозможности указанного удержания и сумме задолженности налогоплательщика. (Письмо Минфина РФ от 16 февраля 2006 года № 03-05-01-04/32).