Организации и предприниматели с начала налогового периода  могут по своему желанию перейти на упрощенную систему налогообложения - УСН (п. 1 ст. 346.13 Налогового кодекса Российской Федерации). Если доход организации по итогам 9 месяцев года, в котором подается заявление, не превышает 45 миллионов рублей и среднесписочная численность работников не превышает 100 человек, то переход на УСН возможен. Следует помнить, что некоторые организации не могут перейти на эту систему налогообложения. Например, к ним относятся организации, имеющие филиалы и представительства, банки  бюджетные учреждения, страховщики и другие. Также нельзя применять УСН, если доля участия других организаций составляет более 25%. Требования, необходимые для перехода на «упрощенку» изложены в статье 346.12 Налогового кодекса.  

Для индивидуальных предпринимателей ограничений перехода на УСН нет.
Заявление о намерении применения УСН, необходимо подать с 1 октября по 30 ноября года, предшествующего переходу на УСН, в инспекцию по месту своего нахождения (месту жительства). Вновь созданная организация и вновь зарегистрированный индивидуальный предприниматель вправе подать заявление о переходе на упрощенную систему налогообложения в пятидневный срок с даты постановки на учет в налоговом органе (п. 2 ст. 346.13 НК РФ).
При этом в Налоговом кодексе РФ не установлена обязанность инспекции направлять в адрес налогоплательщика, перешедшего на УСН, уведомления о возможности или невозможности применения УСН.
При необходимости налогоплательщик может направить в инспекцию письменное обращение с просьбой подтвердить факт применения им УСН. В этом случае инспекция должна в общеустановленные сроки письменно проинформировать обратившегося, что он на основании ранее представленного заявления применяет УСН. Такое сообщение налоговый орган составляет в произвольной форме.
Обращаем внимание, что если при осуществлении деятельности на упрощенной системе сумма дохода организации превысила 60 млн. рублей право на применение УСН теряется. В случае, если налогоплательщик получил от инспекции уведомление о возможности применения УСН и использовал такой спецрежим, а в дальнейшем выяснилось, что УСН применялась в нарушение установленных Налоговым кодексом РФ ограничений, то налогоплательщик должен пересчитать и уплатить налоги по общей системе налогообложения за весь период применения УСН (ст. 346.13 НК РФ). При этом он освобождается от ответственности по ст. ст. 119, 122 и 126 НК РФ, но должен уплатить пени.

Минфин РФ в своем письме № 03-11-06/2/84 от 31.05.2011 разъясняет, можно ли полученное уведомление от  от МИФНС рассматривать как разъяснение, служащее основанием для освобождения организации от ответственности за совершение налоговых правонарушений, если при проведении выездной проверки за 2007-2008 год было установлено, что предприятие не имело право применять УСН, так как учредителем ООО с долей участия в уставном капитале в размере 100% являлось юрлицо.

Ведомство отмечает, что переход организации на УСН производится на основании заявления налогоплательщика и не требует каких-либо разрешений от налогового органа.

При этом в судебно-арбитражной практике указывается, что применение УСН на основании уведомления налогового органа может рассматриваться как обстоятельство, исключающее вину лица в совершении налогового правонарушения.

При этом пени, начисленные за несвоевременную уплату налогов по общему режиму налогообложения, подлежат уплате.

Вновь созданная организация вправе подать в налоговый орган заявление о применении УСН одновременно с подачей заявления о государственной регистрации юридического лица, но не позднее пятидневного срока.

Об этом напоминает ФНС РФ в письме № КЕ-4−3/7644@ от 12.05.2011.

В этом случае организация вправе применять УСН с даты постановки на учет в налоговом органе, указанной в свидетельстве.

Минфин РФ в своем письме № 03-11-06/2/43 от 01.04.2011 разъясняет возможность применения УСН организацией - открытым акционерным обществом при условии, что 100% акций принадлежит Российской Федерации, в лице органа исполнительной власти - Росимущества.

Ведомство напоминает, что согласно  статье 346.12 НК РФ, не вправе применять УСН организации, в которых доля участия других организаций составляет более 25%.

Вместе с тем, Российская Федерация, которая имеет акции в акционерном обществе и осуществляет права акционера через уполномоченный орган, не подпадает под понятие «организация» в целях применения налогового законодательства.

Учитывая изложенное, ОАО, в котором 100% уставного капитала принадлежит РФ в лице уполномоченного органа - Федерального агентства по управлению государственным имуществом, вправе применять УСН.

В соответствии со статьей 346.12 Налогового кодекса РФ не вправе применять упрощенную систему налогообложения организации, в которых доля участия других организаций составляет более 25%.

Вместе с тем, согласно Федеральному закону от 27.11.2010 № 310-ФЗ, данное ограничение не распространяется, в частности, на учрежденные высшими учебными заведениями хозяйственные общества, деятельность которых заключается в практическом применении (внедрении) результатов интеллектуальной деятельности.

Данные изменения вступили в силу с 1 января 2011 г.

В связи с этим при соблюдении всех других условий, предусмотренных гл. 26.2 Кодекса, вышеуказанные хозяйственные общества независимо от состава и количества учредителей, а также размера их доли вправе с 1 января 2011 г. применять УСН.

Такие разъяснения приводит Минфин РФ в письме № 03-11-06/2/27 от 22.02.2011.

Минфин РФ в своем письме № 03-11-06/2/21 от 11.02.2011 разъясняет вправе ли организация применять УСН, если она организовала добычу подземных вод для собственных нужд.

Согласно НК РФ не вправе применять УСН организации и ИП, занимающиеся производством подакцизных товаров, а также добычей и реализацией полезных ископаемых, за исключением общераспространенных полезных ископаемых.

Так, в частности перечень общераспространенных полезных ископаемых по Республике Мордовия утвержден распоряжением Минприроды России № 1-р, Правительством Республики Мордовия № 24-р от 16.01.2008. В указанном Перечне подземные воды не поименованы.

Так как подземные воды не относятся к общераспространенным полезным ископаемым, организация не вправе применять упрощенную систему налогообложения.

352 УСН

ФАС Московского округа в Постановлении от 14 января 2011 г. N КА-А40/16962-10 пояснил, что выбор специального режима - упрощенной системы налогообложения носит уведомительный характер, поэтому несвоевременная подача заявления о переходе на названную систему налогообложения не может служить основанием для отказа обществу в ее выборе.

ФАС указал, что переход к упрощенной системе налогообложения или возврат к общему режиму налогообложения осуществляется организациями и индивидуальными предпринимателями добровольно, в порядке, предусмотренном главой 26.2 Налогового кодекса Российской Федерации.

Вновь созданная организация и вновь зарегистрированный индивидуальный предприниматель вправе подать заявление о переходе на упрощенную систему налогообложения в пятидневный срок с даты постановки на учет в налоговом органе, указанной в свидетельстве о постановке на учет в налоговом органе. В этом случае организация и индивидуальный предприниматель вправе применять упрощенную систему налогообложения с даты постановки их на учет в налоговом органе.

При этом подача заявления по истечении пяти дней с момента постановки на учет в налоговом органе не может служить основанием для отказа обществу в выборе специального режима налогообложения.