ГОЗ и НДС

Здравствуйте! Подскажите пожалуйста, наша организация выполняет заказ по контракту ГОЗ, работаем со спец.счетом в казначействе. Сейчас заключили еще один похожий контракт, ведем раздельный учет затрат. Вопрос, нужно ли вести раздельный учет затрат при расчете НДС? Сейчас к оплате НДС с аванса по второму контракту, могу ли уменьшить НДС на затраты по первому контракту? (первый пока еще тоже не сдан, реализаций не было)