Потеря налоговых IT-льгот: чем это оборачивается для компании и как удержать ставку

Льгота для IT держится на двух условиях — аккредитация Минцифры и доля профильных доходов не менее 70 процентов. Пока оба условия выполняются, компания платит налог на прибыль по ставке 5 процентов и страховые взносы по тарифу 7,6 процента. Стоит хотя бы одному условию отпасть — и ставка налога на прибыль возвращается к общим 25 процентам, а взносы пересчитываются по базовому тарифу. Разница на годовом обороте измеряется десятками миллионов рублей.

С весны 2025 года эта арифметика перестала быть теоретической. Мораторий на выездные проверки аккредитованных IT-организаций закончился, инспекции вернулись к периодам 2022–2024 годов, и претензии по льготам получили десятки компаний. Отдельная волна споров пришлась на бывших резидентов «Сколково», которые после потери статуса попытались сразу перейти на отраслевую IT-ставку. ФНС такой переход в том же году не признаёт.

Ниже разбираем, что именно теряет компания при утрате льготы, где проходит главная линия риска и как выстроить защиту до того, как акт камеральной проверки станет решением.

Льгота состоит из двух частей, и теряются они по разным правилам. По налогу на прибыль аккредитованная IT-компания применяет ставку 5 процентов на основании пункта 1.15 статьи 284 НК РФ. По страховым взносам действует пониженный тариф — 7,6 процента сверх единой базы и 15 процентов в её пределах по статье 427 НК РФ. Единая база на 2026 год составляет 2 979 000 рублей.

Когда доля профильных доходов опускается ниже 70 процентов или аккредитация аннулирована, обе ставки уходят. Налог на прибыль за весь налоговый период считается по общей ставке 25 процентов. Взносы пересчитываются с месяца, в котором условие перестало выполняться. Для компании с фондом оплаты труда в сотни миллионов рублей пересчёт взносов за несколько месяцев — это уже семизначная сумма, а доначисление по прибыли за полный год способно превысить её многократно.

К этим двум потерям с 2026 года добавляется третья, уже не связанная с порогами и аккредитацией. С 1 января 2026 года освобождение от НДС для софта из реестра Минцифры отменяется: более 27 тысяч программных продуктов попадают под ставку 22 процента. Бьёт это по разработчикам сильнее, чем по другим отраслям, — у них почти нет входного НДС, который можно принять к вычету, поэтому налог ложится прямой нагрузкой. Подробнее об этом изменении и его последствиях для отрасли — в Telegram-канале «Ветров и партнёры».

Чтобы оценить масштаб, достаточно сравнить две ставки на одной и той же базе. Прибыль 200 млн рублей по льготной ставке 5 процентов даёт 10 млн налога. Та же прибыль по общей ставке 25 процентов — 50 млн. Разница в 40 млн рублей возникает не из-за роста бизнеса, а только из-за смены налогового режима. Если к этой разнице добавить пени за полтора-два года спора и штраф, итоговая сумма к доплате становится сопоставимой с годовой прибылью.

Отдельный сценарий — потеря статуса резидента «Сколково». Освобождение по статье 246.1 НК РФ действует, пока выручка не превысила 1 млрд рублей, а совокупная прибыль — 300 млн рублей. При превышении выручки право на освобождение утрачивается с 1 января того же года. Прибыль до порога в 300 млн облагается по нулевой ставке, всё, что сверху, — по общим 25 процентам.

Бывший резидент «Сколково», потерявший статус, рассуждает логично: компания аккредитована, доля IT-доходов выше 70 процентов, значит, можно применить льготную ставку 5 процентов к той же прибыли. ФНС с такой логикой не соглашается, и проблема — в датах.

Налог на прибыль привязан к календарному году. Право на IT-ставку по прибыли возникает не раньше 1 января года, следующего за годом потери резидентства. Компания, утратившая статус «Сколково» в январе 2026 года, применит ставку 5 процентов только с 2027 года. За 2026 год её прибыль облагается по общей ставке 25 процентов — независимо от того, что аккредитация Минцифры уже на руках.

Со взносами правило прямо противоположное. Пониженный тариф для IT применяется с месяца утраты «сколковского» статуса, а не со следующего года. То есть по одному и тому же событию — потере резидентства — прибыль и взносы переходят на новую льготу в разные моменты. Этот разрыв и порождает большинство ошибок. Компания заявляет IT-ставку по прибыли за «переходный» год, инспекция при камеральной проверке сопоставляет показатели с порогами статьи 246.1 НК РФ, видит расхождение и доначисляет налог за весь период. Подача уточнённой декларации задним числом право на льготу за этот год не возвращает.

Покажем разрыв на одном примере. Компания превысила порог выручки в 1 млрд рублей в январе 2026 года и в том же месяце получила аккредитацию Минцифры. По страховым взносам она уже с января применяет тариф 7,6 процента — здесь всё чисто. А вот по налогу на прибыль за весь 2026 год она обязана считать налог по ставке 25 процентов, и право на IT-ставку 5 процентов возникнет у неё только с 1 января 2027 года. Если бухгалтерия применит льготную ставку к прибыли 2026 года, камеральная проверка декларации зафиксирует расхождение, и доначисление накроет весь год. Один и тот же набор фактов — потеря статуса и аккредитация — даёт разные даты перехода для двух налогов, и именно на этом стыке компании теряют деньги.

С 1 января 2026 года совмещать резидентские льготы «Сколково» и отраслевые IT-преференции запрещено. Раньше компания, одновременно бывшая участником проекта и аккредитованной IT-организацией, выбирала режим по своему усмотрению, если других нарушений не было. Теперь набор льгот один: либо резидентский, либо отраслевой.

Сильнее всего запрет ударил по страховым взносам. Пониженные IT-тарифы для участников «Сколково» с 2026 года не действуют, и компании пришлось определяться с режимом. Но проблема глубже самой нормы. Даже там, где формального совмещения не было, инспекция отказывает в IT-льготе вслед за потерей «сколковской». Норма заработала с 2026-го, а претензии прилетают за более старые периоды, и компании приходится доказывать, что в прежние годы запрет не применялся.

Претензии по IT-льготам за периоды 2023–2025 годов получили более 50 компаний. Активность проверяющих выросла после 4 марта 2025 года, когда закончился мораторий на выездные проверки аккредитованных IT-организаций. Мораторий вводился письмом ФНС от 24 марта 2022 года во исполнение президентского указа и продлён не был.

С марта 2025 года инспекции проверяют правомерность применения льгот за 2022–2024 годы. Важная деталь: камеральные проверки деклараций шли и в период моратория, поэтому к моменту его отмены у налоговых органов уже была сформирована картина по большинству компаний. Отбор идёт по риск-ориентированному подходу. В автоматическом режиме анализируются состав выручки, динамика прибыли и соответствие критериям аккредитации. Под внимание попадают организации с резким изменением структуры доходов и признаками формального — то есть подогнанного под льготу — соответствия.

В ходе камеральной проверки инспекция запрашивает реестр доходов с разбивкой на профильные и непрофильные, договоры с заказчиками, выписку из реестра аккредитованных организаций, расчёт доли IT-выручки. Если по этим данным доля профильных доходов проседает ниже 70 процентов хотя бы в одном периоде, право на льготу за этот период ставится под вопрос. Поэтому компании важно понимать, как именно она считала долю, и быть готовой объяснить состав каждой строки выручки — особенно когда часть доходов носит смешанный характер и формально может трактоваться в обе стороны.

Помимо споров о моменте перехода, IT-сектор столкнулся со второй угрозой — обвинением в дроблении. Само понятие дробления закреплено Федеральным законом № 176-ФЗ от 12 июля 2024 года.

Под дроблением понимают создание отдельных юрлиц ради занижения налогов и удержания льгот. Выделение IT-направления в самостоятельную компанию нарушением само по себе не является — это нормальный управленческий ход. Риск появляется, когда у новой структуры нет собственных активов, сотрудников и сделок с независимыми контрагентами. Инспекция смотрит на экономический смысл разделения. Общий персонал, единые офисы и расчётные счета, перераспределение выручки между связанными лицами — набор признаков, по которому сделки переквалифицируют.

Последствия доказанного дробления тяжелее обычного доначисления. Схему признают искусственной, налог пересчитывают за три года проверки, а умышленная неуплата тянет за собой штраф 40 процентов от недоимки по пункту 3 статьи 122 НК РФ — вместо стандартных 20 процентов по пункту 1 той же статьи. Когда выделение IT-направления совпало по времени с приближением к порогам льготы, инспекция читает это как умысел, и планка штрафа сразу поднимается.

Защититься от такой переквалификации помогает заранее выстроенная деловая цель. Новая компания должна иметь свой штат разработчиков, а не переведённых на бумаге сотрудников материнской структуры; собственные договоры с заказчиками, а не перевыставленные внутри группы; отдельные офис, счета и управленческие решения. Если выделение объясняется реальной причиной — выходом на новый продукт, привлечением инвестора, разделением рисков, — и эта причина подтверждена документами, у инспекции остаётся мало пространства для вывода об искусственности. Чем раньше компания зафиксировала экономический смысл разделения, тем устойчивее позиция в споре.

Финансовый итог потери льготы складывается из трёх частей. Первая — сам доначисленный налог. При утрате «сколковского» статуса он охватывает прибыль за весь год по ставке 25 процентов с 1 января; при споре о доле IT-доходов — период, в котором условие 70 процентов не выполнялось.

Вторая часть — пени, которые начисляются за каждый день просрочки с момента, когда налог следовало уплатить. Чем дольше тянется спор, тем больше эта сумма.

Третья часть — штраф. Неуплата налога из-за неправомерной льготы влечёт 20 процентов от недоимки по пункту 1 статьи 122 НК РФ. Если инспекция докажет умысел — например, через признаки искусственного дробления, — штраф вырастает до 40 процентов по пункту 3. На крупных доначислениях разница между 20 и 40 процентами исчисляется миллионами, поэтому квалификация нарушения становится отдельным предметом спора. Доначисленный налог при этом уплачивается в полном объёме, а не уменьшается за счёт штрафа.

Защита строится на трёх направлениях. Первое — проверка сроков и процедуры камеральной проверки: нарушение порядка или сроков оформления акта даёт основание для отмены доначисления без спора по существу. Второе — обоснование деловой цели структуры бизнеса, если есть вопрос о дроблении. Третье — корректный расчёт момента перехода между льготами по прибыли и взносам.

Сроки здесь жёсткие. Возражения на акт подаются в течение одного месяца со дня его получения по пункту 6 статьи 100 НК РФ. Пропуск этого месяца лишает компанию права изложить позицию до вынесения решения. Досудебное обжалование обязательно перед обращением в суд по статье 138 НК РФ — миновать вышестоящий налоговый орган и сразу пойти в арбитраж нельзя.

Исход спора во многом решает доказательная база, и собирать её разумнее заранее, а не после получения акта. Реестр профильных доходов, договоры на разработку и сопровождение ПО, документы об аккредитации Минцифры, подтверждение доли IT-доходов не менее 70 процентов — этот пакет снимает основную часть претензий и по прибыли, и по взносам. Когда речь о дроблении, к нему добавляются доказательства самостоятельности каждого юрлица: собственные сотрудники, активы, независимые сделки.

При получении акта порядок действий простой. Зафиксировать дату получения и проверить, уложилась ли инспекция в сроки. Сверить расчёт доначисления с нормами статей 246.1 и 284 НК РФ. Собрать документы об аккредитации и доле доходов. Подать письменные возражения в течение месяца. При отказе — обжаловать решение в вышестоящем органе, и только после этого, если результат не устроит, идти в арбитражный суд.

С какого момента можно применять IT-ставку по прибыли после потери статуса «Сколково»?

По налогу на прибыль аккредитованная IT-компания применяет ставку 5 процентов только с 1 января года, следующего за годом потери резидентства. За сам год утраты статуса прибыль облагается по общей ставке 25 процентов. Уточнённая декларация право на льготу за этот год не возвращает. Основание — пункт 1.15 статьи 284 НК РФ.

Сохранится ли пониженный тариф страховых взносов при потере статуса?

Да, и здесь правило мягче, чем по прибыли. Пониженный тариф для аккредитованной IT-компании применяется с месяца утраты «сколковского» статуса, а не со следующего года. Тариф составляет 7,6 процента сверх единой базы и 15 процентов в её пределах. Условия прежние — доля IT-доходов не менее 70 процентов и действующая аккредитация Минцифры.

Какой штраф грозит за неправомерное применение льготы?

Неуплата налога из-за неправомерной льготы влечёт штраф 20 процентов от недоимки по пункту 1 статьи 122 НК РФ. При доказанном умысле он вырастает до 40 процентов по пункту 3 той же статьи. Дополнительно начисляются пени за каждый день просрочки, а доначисленный налог уплачивается полностью.

Виталий Ветров, управляющий партнёр юридической фирмы «Ветров и партнёры»

29 июня 2026 года