При исправлении платежного документа - исправляйте счет-фактуру

В случае уточнения информации о номерах платежно-расчетных документов, в счета-фактуры, выставленные продавцом, следует внести соответствующие исправления. Причем, внести правку нужно как в экземпляры счетов-фактур, оставшихся у продавца, так и в экземпляры счетов-фактур, выставленных покупателю. (Письмо Минфина РФ от 13/04/2006 № 03-04-09/06).