ФНС начала массово штрафовать крупнейшие компании за использование инвестльгот — доначисления выросли в 8 раз

Компании, которые одновременно применяют несколько механизмов господдержки — например, СЗПК, ФИНВ, региональные ИНВ, статусы резидентов ТОР или ОЭЗ, — оказались под пристальным вниманием ФНС. По словам главы РСПП Александра Шохина, для ряда организаций суммы доначислений и штрафов сопоставимы с годовой выручкой и прибылью.

В 2026 году налоговые органы усилили контроль за правомерностью использования льгот, что подтверждают данные ФНС и эксперты. В первом квартале 2026 года количество выездных проверок крупнейших налогоплательщиков выросло до 42 против 13 за аналогичный период прошлого года, а средняя сумма доначислений увеличилась на 58%, достигнув 223,5 млн рублей. Всего за январь — март крупному бизнесу доначислили 9,4 млрд рублей, что в 8 раз превышает показатели прошлого года. Об этом пишут «Ведомости».

Основной конфликт связан с отсутствием в Налоговом кодексе четких запретов на совмещение некоторых режимов, при этом Минфин занимает ограничительную позицию. В частности, в июле были опубликованы разъяснения, запрещающие совмещать преференции по СЗПК и статус резидента ТОР. Консультанты отмечают, что налоговики склонны агрессивно трактовать нормы, оспаривая правомерность одновременного использования льгот, что ставит под угрозу окупаемость крупных инвестиционных проектов.

«Понимаем желание увеличить поступления в бюджет. И понимаем, что в ряде случаев налоговая действует в пределах своих компетенций. Но в таких условиях стимулировать инвестиции довольно сложно», — сказал Александр Шохин.

Представитель ФНС в свою очередь сообщил, что ведомство применяет риск-ориентированный подход ко всем отраслям и проводит анализ динамики значимых показателей, включая объем получаемых льгот. Проверки инициируются в тех случаях, когда налогоплательщики отказываются от добровольного уточнения обязательств после получения уведомлений о выявленных рисках.