Средства полученные по госсертификату можно включить в расходы

ФНС РФ в своем письме разъясняет правомерность уменьшения налогоплательщиками (военнослужащими) дохода, полученного от продажи жилья, приобретенного за счет безвозмездной субсидии на приобретение жилья на основании Государственного жилищного сертификата, предоставляемой военнослужащему за счет средств федерального бюджета на строительство или приобретение жилья.

В документе отмечается, что налогоплательщик при продаже ранее приобретенной квартиры может учесть все документально подтвержденные расходы по ее приобретению, произведенные за счет собственных средств, включая средства, полученные по Государственному жилищному сертификату.