НДС с авансов у агента

Договор между Принципалом и Агентом, Агент действует от своего имени, но за счет Принципала. Агент организует услуги для Принципала, приобретая их по договору у Поставщика. Договором между Принципалом и Агентом предусмотрена предоплата. Договором между Поставщиком и Агентом предоплата не предусмотрена. Все участники сделки плательщики НДС. Агент получает документы от поставщика и в составе отчета агента перевыставляет Принципалу, агентское вознаграждение оформляется обычной реализацией.

в декабре 23г Принципал согласно выставленного счета перечислил предоплату Агенту в сумме 13 000 000руб (в т.ч. агентское вознаграждение 7 000 000руб и сумма возмещаемых расходов за сами услуги 6 000 000руб.)
На полученную предоплату Агент выставил счет-фактуру на аванс из расчета полной суммы 13 000 000руб. Принципал принял к вычету НДС по полученному счету-фактуре и отразил это в декларации за 2023г. 31.01.24 Агент предоставил Принципалу отчет с приложением подтверждающих документов на общую сумму 13 000 000руб. (см распределение сумм выше), а также УПД на сумму агентского вознаграждения.

Суть вопроса - правомерно/корректно ли Агент составил с/ф на всю сумму полученного аванса? Каким образом должны оформляться документы в части предоплаты по данной схеме? (в какой разбивке выставлять счет на оплату Принципалу, на какую сумму правомерно составить с/ф)

также в данной ситуации есть нюанс: в январе 24г Принципал снова перечисляет аванс Агенту, но уже в повышенном размере 17 000 000 (8 000 000 стоимость услуг Поставщика, 9 000 000 агентское вознаграждение)

Непонятно, как исправить данную ситуацию, и как оформлять счета фактуры на аванс на последующие авансы Принципала (если принять авансовый с/ф за декабрь как предоплату агентского вознаграждения на январь и частично на февраль)

Принципал также негодует, т.к. принял к зачету сумму, декларации пересдавать не вариант.

В таком случае делается неправильно. Счет-фактура на аванс должна быть выставлена только в части агентского вознаграждения.

Денежные средства, поступающие агенту для исполнения поручения, в налоговую базу по НДС не включаются, так как являются финансированием расходов по сделке (п. 1 ст. 156, Письмо УФНС России по г. Москве от 05.12.2007 № 19-11/115925).

Когда полученная 100%-ная предоплата включает предварительно рассчитанное вознаграждение агента, которое, по условиям договора, должно быть признано предоплатой, агент обязан исчислить НДС именно с этой части предоплаты при условии возможности ее выделения из всей полученной суммы аванса. У агента в вашем случае фиксированное агентское вознаграждение, т.е. на момент получения денег от принципала оно известно.

После составления отчета агента выставляется счет-фактура на реализацию агентских услуг.

Поскольку в рассматриваемом случае агент, действует от своего имени, продавец выставляет счет-фактуру на имя агента, а не принципала. После получения счета-фактуры от продавца агент выставляет (перевыставляет) на имя принципала счет-фактуру с отражением показателей счета-фактуры, полученного от продавца, а также передает принципалу заверенную копию исходного счета-фактуры продавца.

Полученный от продавца счет-фактуру агент регистрирует в ч. 2 журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур без регистрации в книге покупок (пп. "а" п. 11 Правил ведения журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур, пп. "г" п. 19 Правил ведения книги покупок).

Надежда, спасибо за подробный ответ! Но остался вопрос в части - как в текущей ситуации исправить все? если принципал принял к вычету всю сумму в декабре, а в январе от агента закрылась только та часть, которая приходится на агентское вознаграждение за январь. соответственно, если на последующий аванс от принципала агент выставит с/ф на аванс только в части своего вознаграждения, по итогам месяца закроется часть НДС по пред. с/ф на аванс и часть от текущей. т.е. будет постоянно зависающий кусок НДС. может, некорректно объяснила... но меня беспокоит именно этот момент, как в итоге выровняться по авансовому НДС. он же не будет в "0" закрываться, а постоянно будет висеть эта лишняя сумма

Тут только корректировки отчетности за 4 квартал. Надо переделывать счет-фактуру на аванс и сдавать утоненки как принципалу, так и агенту.
Налоговая все равно выкинет из вычета "лишний" НДС за 4 квартал у принципала, если они раскопают эту ситуацию. Принципал не имел права брать НДС к вычету с суммы, которая не являлась агентским вознаграждением.
А корректировочные счета-фактуры по авансам не предусмотрены.